O Comando de Policiamento em Missões Especiais (CPME) tem a missão de planejar, coordenar, controlar, fiscalizar e avaliar todas as ações de alta complexidade e intervenções de alto risco desenvolvidas pela PMBA, visando atender a necessidade cada vez maior de atuar de modo especializado nas ações policiais militares, com o objetivo precípuo de preservar vidas humanas, a ordem pública, a incolumidade das pessoas, o patrimônio, as autoridades constituídas, o Estado democrático de direito, a cidadania, além de apoiar as demais unidades Operacionais da corporação como último grau de resposta, bem como exercer a função de tropa de reação do Comando-Geral da Polícia Militar do Estado da Bahia.