A 90ª CIPM foi criada através da Lei nº 13.201, de 09 de dezembro de 2014 – Lei de Organização Básica da PMBA – tendo sua sede instalada em 01 de junho de 2015, no município de Riachão do Jacuípe- BA. Em 09 de feveireiro de 2017, foi inaugurada a nova sede da Unidade, passando a funcionar em um prédio cedido pela Prefeitura Municipal, após celebração de Termo de Cessão de Uso por 20 (vinte) anos, renovável por igual período. Recentemente, passou a integrar o orgânico do Comando de Policiamento da Região da Chapada, integrando a sua área de responsabilidade as cidades de Riachão do Jacuípe, Capela do Alto Alegre, Nova Fátima e Pé de Serra.