A 6ª CIPM foi criada pelo Decreto Estadual n.º 5.363 de 22 de abril de 1996, com área de responsabilidade fixada no município de Porto Seguro. Posteriormente, consoante o Decreto Estadual n.º 8.223, de 24 de abril de 2002, teve a área de responsabilidade transferida para o município de Rio Real, sendo a partir de então, responsável pelos municípios de Acajutiba, Aporá, Crisópolis, Jandaíra e Rio Real (sede). Nesta região, seu primeiro comandante foi o então Capitão QOPM Robson Pacheco. Em 2012, através da Portaria Nº 715, que redefiniu as Regiões Integradas de Segurança Pública – RISP e as Áreas Integradas de Segurança Pública – AISP do Interior do Estado, a 6ª CIPM passou a policiar mais dois municípios, Olindina e Itapicuru, totalizando 07 (sete) municípios sob sua responsabilidade na atualidade. A 6ª CIPM está instalada a 207 km da capital, e a 190 km do Comando de Policiamento da Região Leste (CPR-L) em Feira de Santana, ao qual está diretamente subordinada.
