A 65ªCIPM, foi criada em 06 de janeiro de 2009, conforme a Lei Ordinária 11356/2009. Anteriormente era denominada como 2ª Cia sediada no 1ª Batalhão de Ensino Instrução e Capacitação. Teve seu primeiro Comandante nomeado, o Maj PM Paulo Roberto Cerqueira de Carvalho e durante os primeiros anos de sua criação era responsável por toda região noroeste da cidade. Após a redistribuição das Companhias Independentes ocorrida em 2019 sua área de responsabilidade territorial passou a ser a região sul, tendo como principal, o bairro o Tomba.Desde 12/10/2023 é comandada pelo Major PM Jorge Luís Magalhães de Freitas.
