A 16ª CIPM foi criada através do Decreto Estadual nº 8.230, de 24/04/2002, com sede atual na R. Fernandes Viêira, nº 30 – Mares, Salvador – BA, CEP. 40411-560. A Unidade realiza policiamento ostensivo, em todo seu território, na modalidade motorizada com motocicletas, viaturas e base móvel, com destaque e atuação no Porto de Salvador, Feira de São Joaquim e Mercado Modelo, e possui atualmente um efetivo de 103 (Cento e três) policiais militares.